（1）国际制度的非强制性
国际制度能够对参与其中的行为体进行监督和管理，并对违反国际制度规定的国家采取制裁或惩罚措施。虽然国际制度是国家间以自愿的方式达成的一种框架，但是它关系到了参与其中的行为体的国家利益。当国家采取单方面行动可能破坏国际制度时，国际制度可利用制定的相关规则来对违规国进行惩罚，使其付出较大的交易成本，迫使其放弃不合作行为。同时，由于国际制度内的行为体在相关领域内的利益具有一定的关联性，因此当国家违反国际制度的规定而单独行动时，必然会对其他行为体的利益构成损害而导致其他行为体的报复行为。这使得国家作为一种理性行为体，由于破坏国际制度的规则而付出过高的交易成本而影响其收益时，会自动的约束其对短视利益的追求。
虽然国际制度能够对行为体的行为产生一定的制约作用，但 “国际制度的影响作用是潜在的、潜移默化的，而非强制意义上的。” 国际制度是帮助国家实现目标的一种工具，它与参与其中的国家间的关系并不是等级式的，它无法作为单独的超越国家之上的行为体而存在。因此，“国际制度不能创造出像在组织良好的国内社会中那样的稳固的法律责任模式”。 国际制度不是世界政府，无法像国内社会一样运用国家暴力机关来强制行为体按照规则行事。“只能在顺应国家利益需要和帮助国家集体获益的情况下推动国际机制目标的实现。” 一但国家认为国际制无法为其获得更多的国家利益或者参与国际制度使国家的交易成本大幅度上升时，国家很可能采取改变“游戏规则”的行为，这时国际制度无法强行制止国家的这些行为以及由此而带来的国家间的矛盾和国际社会的危机。例如，以外汇自由化、资本自由化和贸易自由化为主要内容的布雷顿森林体系是按照美国制定的原则，是实现美国经济霸权的一种制度模式。它在一定程度上维护了美国的全球霸权。但是当20世纪60~70年代美国面临国内国外环境不断恶化的困境时，美国于1971年8月15日单方面的宣布停止履行对外国政府或中央银行以美元向美国兑换黄金的义务。使布雷顿森林体系瓦解和崩溃。虽然布雷顿森林体系崩溃以后，国际货币基金组织和世界银行作为重要的国际组织仍得以存在，但作为一种国际制度，该体系无法对美国的这种行为做出有效的制约或惩罚措施却表现出了国际制度本身制约能力的有限性。
（2）国际制度的妥协性
国际制度是国家行为体为最大限度的追求国家利益，保证国家间更好的合作而建立起来的。国家为实现这一目的必然在制定和实施其政策时要考虑到其他行为体的因素而对政策进行适当的调整。因此，国际制度的建立是国家对各种利益的规范之间进行权衡的结果，是国家间彼此妥协的结果。这也就是国际制度具有了一种妥协性。而一个国家的在建立国际制度过程中的妥协程度如何在很大程度上取决于其在该领域以及整个国际社会中的实力大小如何。实力强的国家或者强权国家往往在这一过程中的妥协程度较弱小国家所作出的妥协要低得多。这就使得国际制度在形成之后往往会按照强国的意志行事和发展。这使得国际制度无法体现国际和平与正义等特征，限制其发挥应有的作用。虽然在霸权体系下建立的国际制度能够是一些弱小的国家在集体行动的过程中享受到“搭便车”带来的利益。但是由于国际制度的这种妥协性导致强权国家在国际制度中得到的绝对利益必然要比弱小国家得到的多。长此以往，必然会导致一些国家对此制度产生不满情绪，从而是国际制度内部的行为体之间的矛盾加深甚至激化，给国际社会带来诸多的不稳定因素。
（3）制度内外国家间利益的纷争
国际制度的建立对于促进其内部行为体之间的稳定、和平与有序无疑是有帮助的。但是当今的国际制度并不是将所有国家都囊括在内的，只有达到国际制度所指定的相关标准，行为体才能被允许加入其中。而对于国际制度内的国家与国际制度意外的国家间的关系，国际制度往往不能够起到维护稳定与和平的作用。虽然在全球化时代，国家间相互依赖的程度在不断的加深，非国家行为体的作用在不断的增强，但国际社会依然没有摆脱民族国家这一时代的根本特征。由于国际制度首先是国家追求利益的工具，特别是霸权国家对于国际制度的影响，使得国际制度内的国家往往会因为追求共同的国家利益而利用国际制度对制度意外的行为体做出非正义的行为。这时国际制度并不具有正义的属性，而是利益集团谋求利益的工具。霸权国家对于国际制度的影响和控制使得国际制度很容易就成为霸权国家谋求国际利益的工具，而此时国际制度的非正义性导致了其他国家同国际制度内部国家之间的矛盾和冲突，对整个国际社会的稳定造成了很大的影响。
2001年爆发的美国为打击阿富汗塔利班政权和“9•11事件”头号嫌疑犯本•拉登及其“基地”组织而发动的阿富汗战争使众多北约成员国参与其中。阿富汗战争虽然顺利的推翻了塔利班政权，但此次战争对国际社会和平与稳定所产生的消极影响却至今仍未消除。从2001年战争爆发至今，阿富汗国内的政局依然动荡不安，经常出现“基地”组织的自杀性报复事件，倒置国内居民至今仍然生活在动荡之中，无法享受到安居乐业的生活。而对于参与阿富汗战争的北约国家，也受到“基地”组织在其国内发起的恐怖事件的袭击和恐吓，严重的影响了国内的稳定。由此可见，国际制度内外国家间由于利益而产生的纷争使国际制度在功能发挥的过程中受到了影响，从而破坏了国际社会的稳定与国家间关系的发展。这种局限性无利益国际政治秩序的稳定发展。